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单细胞转录组数据分析实战

单细胞转录组测序,被称为测序领域的“第二次革命”,与传统转录组测序不同,单细胞技术将研究对象从组织细化到细胞,可以加深对细胞异质性和组织微生态特征等的认知。 通过对单细胞的多组学生物特征开展多层次(突变、转录、表观修饰、蛋白质表达等)的研究,以及对细胞间通讯、空间位置的分析,可进一步深化对细胞的分化机制、组织的发育原理及疾病发生机制的理解。 基于此,本课程从实战出发,介绍了单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)上游分析(Linux系统)和下游分析(R语言)中常用的分析软件包和在线分析工具。 结合实际案例,详细讲解了在线分析工具IRIS3和SC1的工作流程、参数解析和实际操作,以方便零基础学员入门单细胞转录组分析。 最后,课程精选了DRscDB、scRNASeqDB、HCL和MCA等四个单细胞数据数据库进行讲解,这些数据库搜集整理了大量的单细胞转录组数据集,可结合学到的工具直接用于数据挖掘,实为单细胞数据挖掘的保姆级教程。

Arjuna・解螺旋

翡翠讲师

翡翠讲师Arjuna,擅长R语言,Linux系统,各种组学测序分析软件,从2017年开始在解螺旋开设精品课程,包括《高通量测序数据分析》《TCGA数据库实战》等。曾在线下讲座教授过Linux系统、转录组测序分析、WGCNA分析等,广受好评。

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